Abaixo destaca-se os principais equipamentos em laboratórios do PPGBM:
Sequenciadores: Quatro plataformas de Sequenciamento de Nova Geração (MiniSeq, MiSeq e NextSeq500 e NextSeq 2000 - Illumina); Chromium Single Cell (10X Genomics), PromethION™️ P2 (Oxford Nanopore), Analisadores Genéticos Thermo Fisher Scientific - 3500 (2 unid), 3130 (4 unid) e 3730.
PCR e Eletroforese: QuantStudio 12K Flex (Thermo Fisher Scientific), PCR em Tempo Real 7.500 (4 unid - Applied Biosystems), Rotor-Gene Q (Qiagen), RT-qPCR AriaMx (Agilent) e EcoReal Time (2 unid - Illumina)], termocicladores (30 unid). E-Gel PowerSnap (Thermo Fisher Scientific), TapeStation (4 unid - Agilent), DGGE, cubas e fontes para eletroforese (verticais e horizontais), transiluminador ultravioleta (6 unid).
Preparação de Amostras: Ultrassonicador (Covaris Inc.), liofilizador, banho-maria com agitação e simples, termoblocos, hibridizador de ácido nucléico, robôs extratores automatizados (DNA e RNA) - KingFisherFlex (Thermo Fisher) e Maxwell 16 MDx (Promega), sistemas de criogenia em nitrogênio liquido.
Análise de cariótipo: Microscópio de microdissecção a laser (Leica), microscópio (Axiophot II, Axioskop II, Zeiss I, Zeiss III e Jenalumar), todos com dispositivo fotográfico, dotados de sistema de fluorescência; um sistema de captura de imagens Axiovision, estufa bacteriológica com CO2, estufa bacteriológica sem CO2, invertoscópio (Zeiss acoplado a sistema de captura de imagens Axiovision).
Purificação e Análise: HPLC, sistema de osmose reversa, ultra purificador de água, destilador de água, transiluminadores ultravioleta, fotodocumentador E-BOX (Vilber), scanner de mesa, citômetro de fluxo – FacsVerse e Canto II (2 unid- BD Bioscience), citômetro de fluxo ACCURI C6TM Plus System.
Centrífugas e Armazenamento: Centrífugas refrigeradas (5 unid), Centrífugas (8 unid), microcentrífugas (10 und), freezers -80°C (10 unid) e -20°C (30 unid), geladeiras, máquinas de gelo (5 unid).
Ambiente Laboratorial: Cabines de segurança biológica (5 unid), fluxo laminar (5 unid), capela química, capela exaustora, balanças (comum e alta precisão), agitador de tubos com regulação de temperatura, estufas (37°C e 100°C), lavador ultrasônico, autoclave, sistema Milli-Q, bidestilador de água.
No que diz respeito a estrutura computacional de alto desempenho, são utilizadas na forma multiusuária por diversos grupos do PPGBM. Esta consta com servidores que executam as atividades voltadas para ensino, pesquisa e análises bioinformáticas, destacam-se:
Informática: Ada - Servidor de Processamento [Processador AMD Ryzen Threadripper, 3960X, 24C/48T, 3.8/4.5GHZ, memória 128 GB (8x16GB), DDR4-3000 RAM expansível até 512GB, HDD 10TB SATA 7.2KRPM, SSD 250GB M.2 NVMe, GPU - NVIDIA RTX 3090, 24GB, GDDR6X 10496 CUDA Cores]. Darwin - Servidor de Processamento [Processador Intel Xeon 3.0 GHz, memória 28GB, Disco 2.2T]. Eva - Servidor de Processamento [Intel core i9-10900K, 10C/20T, 3.7/5.3GHZ, memória 16GB (1x16GB), DDR4-3000 expansível até 128GB, HDD 2TB SATA 7.2KRPM, SSD 250GB M.2 NVMe, GPU - NVIDIA RTX 3070, 8GB, GDDR6 5888 CUDA Cores]. Mendel - Servidor Web [Processador Intel core i5, 3.4Ghz, core 4, memória 4GB, Disco 1TB]. Noé - Cluster de Processamento [Servidor em Rack PowerEdge R630, servidor em Rack PowerEdge R620, um frontend - 2x Intel Xeon 8x2 2.33GHz 64GB RAM, dois nodos - 2x Intel Xeon 8x2 2.9GHz 128GB RAM, um storage Dell PowerVault 3200, um storage Dell Powervault 1400, um storage Dell Powervault 1200, um switch gigaeth, um switch infiniband, entre outros equipamentos mais básicos de suporte.